CpG島分析工(gōng)具(CpG Islands)

CpG島分析工(gōng)具用(yòng)于分析CpG島的潛在區(qū)域,分析算(suàn)法請(qǐng)參考文(wén)獻Gardiner-Garden and Frommer (1987)。算(suàn)法采用(yòng)大(dà)小(xiǎo)爲200bp、步長爲1的滑動窗口進行計(jì)算(suàn)。CpG島是Obs/Exp值大(dà)于60%,GC含量大(dà)于50%的一段序列。期望值(Exp)=‘C’的出現(xiàn)次數 * ‘G’的出現(xiàn)次數 / 滑動窗口大(dà)小(xiǎo)。CpG島一般出現(xiàn)在脊椎動物基因的5'端,所以此工(gōng)具可以在基因組中标記出潛在基因。

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