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别問蛋白(bái)有多少,掌握定量方法再來(lái)說

發表時(shí)間:2023-02-27 訪問次數:246

蛋白(bái)定量

蛋白(bái)定量即蛋白(bái)質定量,蛋白(bái)質定量根據其目的分爲蛋白(bái)質的“總定量”和(hé)特定蛋白(bái)質的“個别定量”。蛋白(bái)定量是生物學實驗不可缺少的一部分,爲驗證細胞裂解是否成功,或爲了(le)将多個樣品進行平行實驗比較或标準化保存,需對(duì)細胞裂解液進行蛋白(bái)定量;爲了(le)判定蛋白(bái)的産量,需對(duì)純化好(hǎo)的蛋白(bái)進行定量;爲了(le)将純化好(hǎo)的蛋白(bái)用(yòng)生物素或報(bào)告酶進行标記,同樣需要首先對(duì)蛋白(bái)樣品進行定量,以保證标記反應在适當的化學濃度下(xià)進行。

 

蛋白(bái)質是一種十分重要的生物大(dà)分子,它種類繁多,結構不一,功能(néng)各異,分子量相差很(hěn)大(dà),因此建立一個理(lǐ)想而又通用(yòng)的蛋白(bái)質定量分析方法很(hěn)因難。

現(xiàn)測定蛋白(bái)質含量的方法有很(hěn)多:根據物理(lǐ)性質來(lái)分有紫外(wài)分光光度法;根據化學性質來(lái)分有凱氏定氮法、雙縮脲法、Folin-酚試劑法(Lowary法)、BCA法和(hé)膠體金(jīn)法;根據染色性質有考馬斯亮(liàng)藍染色法、銀染法;根據其他(tā)性質有熒光法;其中較爲常見的有以下(xià)五種。

 

1

紫外(wài)分光光度法

 

蛋白(bái)質分子中含有共轭雙鍵的酪氨酸、色氨酸等芳香族氨基酸具有吸收紫外(wài)光的性質,其吸收高(gāo)峰在280 nm波長處,且在此波長内吸收峰的光密度值與蛋白(bái)濃度成正比,故可作(zuò)爲蛋白(bái)質定量測定的依據。該方法是最快(kuài)的蛋白(bái)質定量方法,但(dàn)由于各種蛋白(bái)質中酪氨酸和(hé)色氨酸含量不同,如要準确定量則應有待測蛋白(bái)質的純品作(zuò)爲标準來(lái)比較,或者知(zhī)道(dào)其消光系數作(zuò)爲參考。另外(wài),不少雜(zá)質在280 nm波長下(xià)也(yě)有—定吸收能(néng)力,可能(néng)發生幹擾,其中核酸(嘌呤和(hé)嘧啶)的影響尤爲嚴重。核酸的最大(dà)吸收峰是在260 nm,因此若溶液中存在核酸,必須同時(shí)測定OD260與OD280然後根據兩種波長的吸收度比值,通過經驗公式校正,以消除核酸的影響而推算(suàn)出蛋白(bái)質的真實含量。 

操作(zuò)簡便迅速,且不消耗樣品(可以回收),多用(yòng)于純化蛋白(bái)質的微量測定。

(1)當待測的蛋白(bái)質與标準蛋白(bái)質中的酪氨酸和(hé)色氨酸含量差異較大(dà)時(shí),會(huì)産生—定誤差。

(2)混有核酸時(shí)必須分别測定280 nm和(hé)260 nm兩處的OD值,再按公式推算(suàn)蛋白(bái)質含量。

 

2

雙縮脲法

 

雙縮脲(NH3CONHCONH3)是兩個分子脲經180℃左右加熱放(fàng)出一個分子氨後得到(dào)的産物。在強堿性溶液中,雙縮脲與CuSO4形成紫色絡合物,稱爲雙縮脲反應。凡具有兩個酰胺基或兩個直接連接的肽鍵,或能(néng)通過一個中間碳原子相連的肽鍵,這(zhè)類化合物都有雙縮脲反應。紫色絡合物顔色的深淺與蛋白(bái)質濃度成正比,而與蛋白(bái)質分子量及氨基酸成分無關,故可用(yòng)來(lái)測定蛋白(bái)質含量。測定範圍爲1-10 mg蛋白(bái)質。幹擾這(zhè)一測定的物質主要有硫酸铵、Tris緩沖液和(hé)某些(xiē)氨基酸等。

較快(kuài)速 ,不同的蛋白(bái)質産生顔色的深淺相近,以及幹擾物質少。

靈敏度差,常用(yòng)于需要快(kuài)速但(dàn)并不需要十分精确的蛋白(bái)質測定。

3

考馬斯(Comessie)亮(liàng)蘭結合法

 

考馬斯亮(liàng)蘭結合法是近年來(lái)發展起來(lái)的蛋白(bái)質定量測定法。考馬斯亮(liàng)蘭能(néng)與蛋白(bái)質的疏水(shuǐ)區(qū)相結合,這(zhè)種結合具有高(gāo)敏感性,考馬斯亮(liàng)蘭G250 的最大(dà)光吸收峰在465 nm,當它與蛋白(bái)質結合形成複合物時(shí),其最大(dà)吸收峰變爲595 nm。在一定範圍内,考馬斯亮(liàng)蘭G250-蛋白(bái)質複合物呈青色。在595 nm下(xià),光密度與蛋白(bái)質含量呈線性關系。故可以用(yòng)于蛋白(bái)質含量的測定。

(1)操作(zuò)簡便、快(kuài)速;檢測靈敏;重複性好(hǎo)。 

(2)顯色迅速,約2分鐘(zhōng)内可完成染料與蛋白(bái)質的結合,所現(xiàn)顔色至少在1小(xiǎo)時(shí)内是穩定的。 

(3)與改良Lowary法相比,幹擾物質較少。 

(1)當樣品中存在較大(dà)量的SDS、TritonX-100等去垢劑時(shí),顯色反應會(huì)受到(dào)幹擾。如樣品緩沖液呈強堿性時(shí)也(yě)會(huì)影響顯色,故必須預先處理(lǐ)樣品。 

(2)考馬斯亮(liàng)蘭G250染液不宜久存,以1-2月爲宜。 

4

Lowary蛋白(bái)定量法

 

 

Lowary法是雙縮脲法和(hé)福林(lín)酚法的結合與發展,其原理(lǐ)是:蛋白(bái)質溶液用(yòng)堿性銅溶液處理(lǐ),形成銅-蛋白(bái)質的絡合鹽,在加入酚試劑後,除使肽鏈中酪氨酸、色氨酸和(hé)半胱氨酸等顯色外(wài),還使雙縮脲法中肽鍵、堿性銅的顯色效果更強烈。因此,Lowary法的顯色效果比單獨使用(yòng)酚試劑強烈3-15倍,爲雙縮脲法的100倍。由于肽鍵顯色效果增強,從(cóng)而減小(xiǎo)了(le)因蛋白(bái)質種類引起的偏差。 

注意事(shì)項

(1)酚試劑隻在酸性條件穩定,故當其加到(dào)堿性的銅-蛋白(bái)質溶液中時(shí),必須立即混勻,以便在磷钼酸-磷鎢酸試劑被破壞前,還原反應即能(néng)發生。 

(2)爲了(le)保證反應進行完全,反應在25~30℃水(shuǐ)浴中進行,反應30 min後準時(shí)比色。 

(3)避免還原物質幹擾本實驗。 

微克級高(gāo)靈敏度定量測定,穩定。

(1)受植物體内存在的酚類物質幹擾。

(2)去污劑如TritonX-100,SDS,NP-40的濃度超過0.2%時(shí)會(huì)影響定量結果。

 

5

BCA法

BCA( Bicinchoninic acid)法是近來(lái)廣爲應用(yòng)的蛋白(bái)定量方法。其原理(lǐ)與Lowary法蛋白(bái)定量相似,即在堿性環境下(xià)蛋白(bái)質與Cu2+絡合并将Cu2+還原成Cu1+。BCA與Cu1+結合形成穩定的紫藍色複合物,在562 nm處有高(gāo)的光吸收值并與蛋白(bái)質濃度成正比,據此可測定蛋白(bái)質濃度。

BCA蛋白(bái)定量法需要兩種試劑:

試劑A:稱取1 g sodium bicinchoninate,2 g Na2CO3,0.16 g酒石酸鈉,0.4 g NaOH和(hé)0.95 g NaHCO3,定容到(dào)100 ml,用(yòng)NaOH将pH調到(dào)11.25。

試劑B:将0.4 g CuSO4•5H2O溶于10 ml水(shuǐ)中。

工(gōng)作(zuò)液:100份試劑A和(hé)2份試劑B混合。

測量方法:取25 μl 标準品加入到(dào)200 μl BCA工(gōng)作(zuò)液中,37℃或60 ℃孵育30 min,檢測562 nm處的吸光度繪制标準曲線。用(yòng)同樣的方法檢測蛋白(bái)樣品的吸光度可算(suàn)出蛋白(bái)樣品的濃度。

 

(1)靈敏度高(gāo),檢測濃度下(xià)限達到(dào)25 μg/ml,最小(xiǎo)檢測蛋白(bái)量達到(dào)0.5 μg,待測樣品體積爲1-20 μl。

(2)操作(zuò)簡單,快(kuài)速,45分鐘(zhōng)内完成測定,比經典的Lowary法快(kuài)4倍且更加方便。

(3)測定蛋白(bái)濃度不受絕大(dà)部分樣品中的去污劑等化學物質的影響,可以兼容樣品中高(gāo)達5%的SDS,5%的Triton X-100,5%的Tween 20,60,80。

(4)在20-200 μg/ml濃度範圍内有良好(hǎo)的線性關系。

(5)檢測不同蛋白(bái)質分子的變異系數遠小(xiǎo)于考馬斯亮(liàng)藍蛋白(bái)定量法。

(6)經濟實用(yòng),除試管外(wài),測定可在微闆孔中進行,大(dà)大(dà)節約樣品和(hé)試劑用(yòng)量。

受螯合劑和(hé)略高(gāo)濃度的還原劑(EDTA小(xiǎo)于10 mM,DTT小(xiǎo)于1 mM,巯基乙醇低(dī)于1mM)的影響。

 


以上(shàng)是針對(duì)全蛋白(bái)質的“總定量法”,然而許多實驗需要對(duì)溶液中特定蛋白(bái)進行定量分析,即針對(duì)特定蛋白(bái)質的“個别定量”。針對(duì)特定蛋白(bái)定量常用(yòng)的方法有酶聯免疫吸附試驗法(ELISA),免疫印迹分析法(WB)和(hé)質譜檢測(MS)。


 

1

ELISA

 

 

ELISA是溶液中特定蛋白(bái)定量的一種常用(yòng)方法,通常是在96孔闆上(shàng)進行,關鍵步驟是特定抗原/蛋白(bái)的固定。具體來(lái)說,ELISA有不同變種。

直接或間接ELISA

特定抗原/蛋白(bái)直接吸附到(dào)檢測闆,封閉未被抗原包被的孔闆表面,然後在孔闆中加入酶标(直接ELISA)或未酶标(間接ELISA)的第一抗體,在測試孔闆中,一抗與抗原/蛋白(bái)相結合。對(duì)于未酶标的第一抗體,加入酶标的第二抗體與第一抗體結合。最後,加入酶底物(通常是四甲基聯苯胺TMB或堿性磷酸酶ALP)使溶液發生顔色變化然後使用(yòng)分光光度計(jì)檢測。顔色變化與蛋白(bái)質濃度是直接相關的。

直接ELISA的優點是速度快(kuài),并且沒有第二抗體的交叉反應問題,但(dàn)局限是第一抗體的标記可能(néng)是費時(shí)和(hé)昂貴的。此外(wài),信号放(fàng)大(dà)是最弱的。因此,更常用(yòng)的是

夾心ELISA

特定抗原/蛋白(bái)結合在孔闆表面包被的第一抗體(捕獲抗體)和(hé)酶标的第二抗體(檢測抗體)之間,第二抗體比較容易買到(dào),但(dàn)可能(néng)會(huì)發生第二抗體的交叉反應。

任何ELISA測定蛋白(bái)質濃度的一個重要環節都是蛋白(bái)質标準曲線,通常是連續稀釋已知(zhī)濃度的蛋白(bái)質,從(cóng)而繪制标準曲線。

2

WB

 

WB隻能(néng)半定量。通過凝膠電泳把原始或變性的蛋白(bái)質分開(kāi),把蛋白(bái)質轉膜(硝酸纖維素或PVDF),然後使用(yòng)特定的酶标抗體檢測。最後,加入适當的底物(化學發光底物)産生可檢測的信号。雖然WB比ELISA更費時(shí),但(dàn)是WB不僅可以對(duì)特定的蛋白(bái)進行定量,而且可以在實驗中同時(shí)檢測蛋白(bái)質修飾。

3

MS

 

MS是蛋白(bái)質定量的新興方法。在蛋白(bái)質組學分析中,除了(le)蛋白(bái)定性之外(wài),一個重要的步驟就是對(duì)特定的蛋白(bái)進行定量分析。MS定量蛋白(bái)的方法有很(hěn)多。

  • 常用(yòng)的方法是較重的穩定同位素碳(13C)或氮(15N)加入到(dào)第一個樣本(多肽或蛋白(bái)質),而相應的輕同位素(12C和(hé)14N)加入到(dào)第二個樣本(内标),然後混合這(zhè)兩個樣本進行分析。由于兩個樣本的質量差,用(yòng)質譜分析儀測定的兩個樣本峰強度的比值就相當于其相對(duì)豐度比。

  • 質譜蛋白(bái)定量的第二種方法,可以不用(yòng)标記樣本,即用(yòng)基質輔助激光解吸/電離 - MALDI分析。

使用(yòng)質譜這(zhè)種通用(yòng)方法可以在一次實驗中同時(shí)進行定量和(hé)定性檢測。但(dàn)這(zhè)種方法需要的檢測儀器很(hěn)昂貴,從(cóng)而限制了(le)該方法的使用(yòng)。

 

總之,雖然測定蛋白(bái)質含量的方法很(hěn)多,但(dàn)還沒有一個完美(měi)的方法。在選擇測定方法時(shí),可根據實驗要求和(hé)實驗室條件決定。