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JACS | 利用(yòng)噬菌體展示技術篩選具有不對(duì)稱分子骨架的大(dà)環肽

發表時(shí)間:2023-03-24 訪問次數:212



大(dà)環肽(MPs)被認爲是發現(xiàn)治療藥物和(hé)開(kāi)發化學探針的一類特殊化合物。相比于線性多肽MPs環化構象靈活性更高(gāo)以高(gāo)親和(hé)力和(hé)選擇性破壞蛋白(bái)質−蛋白(bái)質界面MPs(<15個氨基酸)可誘導低(dī)免疫應答(dá),并且對(duì)蛋白(bái)酶降解表現(xiàn)出良好(hǎo)的穩定性。

自(zì)然界中發現(xiàn)大(dà)量存在的MPs是自(zì)然進化的結果那麽能(néng)否在實驗室中通過某種技術獲得MPs呢(ne)?研究人員基于現(xiàn)有的體外(wài)和(hé)體内篩選策略,利用(yòng)噬菌體展示技術,通過二硫鍵的形成、(對(duì)稱)交聯劑的使用(yòng)或非天然氨基酸的加入,在噬菌體表面獲得MPs。

爲了(le)使線性前體與不對(duì)稱分子支架的直接環化,文(wén)章還提出一種通過對(duì)獨特的半胱氨酸殘基和(hé)N-端胺進行程序化修飾來(lái)獲得MPs的有效的兩步策略。證明(míng)了(le)這(zhè)種方法從(cóng)合成肽和(hé)噬菌體上(shàng),都能(néng)産生具有不對(duì)稱環化單元的MPs。環化策略與傳統的噬菌體展示是兼容的,并能(néng)夠針對(duì)模型靶蛋白(bái)篩選MP結合物。

針對(duì)這(zhè)種二步環化策略文(wén)章建立了(le)多個模型肽,通過色譜、質譜、NMR等手段驗證了(le)這(zhè)一策略的可行性,并觀察環化策略在噬菌體上(shàng)的相容性。發現(xiàn)在整個噬菌體上(shàng)添加親電交聯劑或NaBH3CN來(lái)修飾多肽對(duì)噬菌體的感染性沒有顯著影響。

最後,文(wén)章中利用(yòng)這(zhè)一環化策略對(duì)鏈黴親和(hé)素進行了(le)噬菌體篩選。發現(xiàn)三條多肽,SAV1−3,它們在樣本中高(gāo)度富集。對(duì)這(zhè)三條多肽進行親和(hé)力表征結果證明(míng)了(le)兩步環化策略可以直接集成到(dào)标準噬菌體展示方案中,以便于針對(duì)蛋白(bái)質靶标選擇天然産物類MP結合體。

這(zhè)種選擇性的兩步環化方法與整個噬菌體的兼容性使得能(néng)夠進行針對(duì)鏈黴親和(hé)素的噬菌體篩選。爲配體多樣化在藥物發現(xiàn)和(hé)化學探針的開(kāi)發中提供更多機會(huì)。